Bio.PDB.mmtf.mmtfio 模組

寫入 MMTF 檔案。

class Bio.PDB.mmtf.mmtfio.MMTFIO

基底類別： StructureIO

將 Structure 物件寫入為 MMTF 檔案。

範例

>>> from Bio.PDB import MMCIFParser
>>> from Bio.PDB.mmtf import MMTFIO
>>> parser = MMCIFParser()
>>> structure = parser.get_structure("1a8o", "PDB/1A8O.cif")
>>> io=MMTFIO()
>>> io.set_structure(structure)
>>> io.save("bio-pdb-mmtf-out.mmtf")
>>> import os
>>> os.remove("bio-pdb-mmtf-out.mmtf")  # tidy up

__init__()

初始化。

save(filepath, select=_select)

將結構儲存到檔案。

參數:

• filepath (字串) – 輸出檔案

• select (物件) – 選擇哪些實體將被寫入。

通常 select 是 L{Select} 的子類別，它應該具有以下方法

• accept_model(model)

• accept_chain(chain)

• accept_residue(residue)

• accept_atom(atom)

如果實體要被寫出，這些方法應該回傳 1，否則回傳 0。