Bio.PDB.Model 模組

模型類別，用於 Structure 物件。

class Bio.PDB.Model.Model(id, serial_num=None)

基底類別：Entity[Structure, Chain]

代表結構中模型的物件。

在從 X 射線晶體學實驗得出的結構中，通常只會存在單一模型（某些例外情況除外）。核磁共振結構通常包含許多不同的模型。

__init__(id, serial_num=None)

初始化。

參數

• id - 整數

• serial_num - 整數

__repr__()

返回模型識別符。

get_chains()

返回鏈。

get_residues()

返回殘基。

get_atoms()

返回原子。

atom_to_internal_coordinates(verbose: bool = False) → None

從原子 X、Y、Z 坐標建立/更新內部坐標。

內部坐標是鍵長、鍵角和二面角。

參數:

bool (verbose) – 預設為 False，描述執行時問題

__orig_bases__ = (Bio.PDB.Entity.Entity[ForwardRef('Structure'), ForwardRef('Chain')],)

__parameters__ = ()

internal_to_atom_coordinates(verbose: bool = False) → None

從內部坐標建立/更新原子坐標。

參數:

bool (verbose) – 預設為 False，描述執行時問題

引發:

Exception – 如果任何鏈沒有 .pic 屬性