Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_text 模組

用於 Exonerate 純文字輸出格式的 Bio.SearchIO 解析器。

class Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_text.ExonerateTextParser(handle)

基底類別： _BaseExonerateParser

用於 Exonerate 純文字輸出的解析器。

parse_alignment_block(header)

解析比對區塊，傳回查詢結果、命中和 HSP。

__abstractmethods__ = frozenset({})

class Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_text.ExonerateTextIndexer(filename, **kwargs)

基底類別： _BaseExonerateIndexer

用於 Exonerate 純文字的索引器類別。

get_qresult_id(pos)

從最接近的 "Query:" 行傳回查詢 ID。

get_raw(offset)

從給定的偏移量傳回 QueryResult 物件的原始字串。

__abstractmethods__ = frozenset({})