Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_cigar 模組
用於 Exonerate cigar 輸出格式的 Bio.SearchIO 解析器。
- class Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_cigar.ExonerateCigarParser(handle)
基底類別:
_BaseExonerateParser
用於 Exonerate cigar 字串的解析器。
- parse_alignment_block(header)
解析 cigar 格式的對齊區塊,返回查詢結果、命中、hsps。
- __abstractmethods__ = frozenset({})
- class Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_cigar.ExonerateCigarIndexer(filename, **kwargs)
基底類別:
ExonerateVulgarIndexer
用於 exonerate cigar 行的索引類別。
- get_qresult_id(pos)
返回最接近的 cigar 行的查詢 ID。
- __abstractmethods__ = frozenset({})