Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_cigar 模組

用於 Exonerate cigar 輸出格式的 Bio.SearchIO 解析器。

class Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_cigar.ExonerateCigarParser(handle)

基底類別: _BaseExonerateParser

用於 Exonerate cigar 字串的解析器。

parse_alignment_block(header)

解析 cigar 格式的對齊區塊,返回查詢結果、命中、hsps。

__abstractmethods__ = frozenset({})
class Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_cigar.ExonerateCigarIndexer(filename, **kwargs)

基底類別: ExonerateVulgarIndexer

用於 exonerate cigar 行的索引類別。

get_qresult_id(pos)

返回最接近的 cigar 行的查詢 ID。

__abstractmethods__ = frozenset({})