Bio.SCOP.Hie 模組

處理 SCOP 階層檔案。

SCOP 階層檔案以 SCOP 唯一識別符（sunid）描述 SCOP 階層結構。

檔案格式在 SCOP 發行說明中描述。

最新的 HIE 檔案可以在 SCOP 的其他地方找到。

版本 1.55 (2001 年 7 月)。

class Bio.SCOP.Hie.Record(line=None)

繼承： object

保存 SCOP 階層中一個節點的資訊。

屬性

  • sunid - 此節點的 SCOP 唯一識別符

  • parent - 父節點的 sunid

  • children - 子節點 sunids 的序列

__init__(line=None)

初始化類別。

__str__()

將 SCOP 階層記錄表示為字串。

Bio.SCOP.Hie.parse(handle)

將 HIE 檔案中的每一行作為 Hie 記錄進行迭代。

參數

  • handle - 類似檔案的物件。