Bio.SCOP.Dom 模組

處理 SCOP DOMain 檔案。

DOM 檔案已正式棄用。更多資訊請參閱 SCOP「版本說明」：http://scop.berkeley.edu/release-notes-1.55.html 舊版本的 DOM 檔案可以在「SCOP 其他地方」找到：http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/parse/

class Bio.SCOP.Dom.Record(line=None)

基底類別：object

保存一個 SCOP 結構域的資訊。

屬性

• sid - 條目的 SCOP ID，例如 d1anu1

• residues - 作為 Residues 物件的結構域定義

• hierarchy - 一個字串，指定此結構域在層次結構中的位置。

__init__(line=None)

初始化類別。

__str__()

將 SCOP 結構域記錄表示為一個 Tab 分隔的字串。

Bio.SCOP.Dom.parse(handle)

迭代 DOM 檔案，將每一行作為一個 Dom 記錄。

參數

• handle – 類檔案物件。