Bio.Phylo.Newick 模組

對應 Newick 樹狀結構的類別,也用於 Nexus 樹狀結構。

請參閱 Bio.Nexus 中的類別:Trees.Tree、Trees.NodeData 和 Nodes.Chain。

class Bio.Phylo.Newick.Tree(root=None, rooted=False, id=None, name=None, weight=1.0)

基底類別:Tree

Newick 樹狀結構物件。

__init__(root=None, rooted=False, id=None, name=None, weight=1.0)

初始化 Newick 樹狀結構物件的參數。

class Bio.Phylo.Newick.Clade(branch_length=None, name=None, clades=None, confidence=None, comment=None)

基底類別:Clade

Newick 分支(子樹)物件。

__init__(branch_length=None, name=None, clades=None, confidence=None, comment=None)

初始化 Newick 分支物件的參數。