Bio.PDB.StructureAlignment 模組

基於 FASTA 比對，將兩個結構的殘基互相對應。

class Bio.PDB.StructureAlignment.StructureAlignment(fasta_align, m1, m2, si=0, sj=1)

基底類別： object

基於序列比對來對齊兩個結構的類別。

__init__(fasta_align, m1, m2, si=0, sj=1)

初始化。

屬性

• fasta_align - 比對物件

• m1, m2 - 兩個模型

• si, sj - 在比對物件中，對應到結構的序列

get_maps()

對應兩個結構之間的殘基。

返回兩個字典，將一個結構中的殘基對應到另一個結構中的等效殘基。

get_iterator()

建立一個迭代器，遍歷所有殘基對。