Bio.PDB.Structure 模組
結構類別,代表巨分子結構。
- class Bio.PDB.Structure.Structure(id)
基底類別:
Entity
[None
,Model
]Structure 類別包含 Model 實例的集合。
- __init__(id)
初始化類別。
- __repr__()
傳回結構識別符。
- get_models()
傳回模型。
- get_chains()
從模型傳回鏈。
- get_residues()
從鏈傳回殘基。
- get_atoms()
從殘基傳回原子。
- atom_to_internal_coordinates(verbose: bool = False) None
從原子 X,Y,Z 座標建立/更新內部座標。
內部座標為鍵長、角度和二面角。
- 參數:
bool (verbose) – 預設為 False,描述執行時問題
- internal_to_atom_coordinates(verbose: bool = False) None
從內部座標建立/更新原子座標。
- 參數:
bool (verbose) – 預設為 False,描述執行時問題
- 引發:
Exception – 如果任何鏈沒有 .internal_coord 屬性
- __orig_bases__ = (Bio.PDB.Entity.Entity[NoneType, ForwardRef('Model')],)
- __parameters__ = ()