Bio.PDB.Structure 模組

結構類別,代表巨分子結構。

class Bio.PDB.Structure.Structure(id)

基底類別:Entity[None, Model]

Structure 類別包含 Model 實例的集合。

__init__(id)

初始化類別。

__repr__()

傳回結構識別符。

get_models()

傳回模型。

get_chains()

從模型傳回鏈。

get_residues()

從鏈傳回殘基。

get_atoms()

從殘基傳回原子。

atom_to_internal_coordinates(verbose: bool = False) None

從原子 X,Y,Z 座標建立/更新內部座標。

內部座標為鍵長、角度和二面角。

參數:

bool (verbose) – 預設為 False,描述執行時問題

internal_to_atom_coordinates(verbose: bool = False) None

從內部座標建立/更新原子座標。

參數:

bool (verbose) – 預設為 False,描述執行時問題

引發:

Exception – 如果任何鏈沒有 .internal_coord 屬性

__orig_bases__ = (Bio.PDB.Entity.Entity[NoneType, ForwardRef('Model')],)
__parameters__ = ()