Bio.ExPASy.Prodoc 模組

用於處理來自 Prosite 的 prosite.doc 檔案的程式碼。

請參閱 https://www.expasy.org/prosite/

已測試版本
  • Release 15.0, 1998 年 7 月

  • Release 16.0, 1999 年 7 月

  • Release 20.22, 2007 年 11 月 13 日

  • Release 20.43, 2009 年 2 月 10 日

函式
  • read 讀取包含單一 Prodoc 條目的 Prodoc 檔案。

  • parse 迭代 Prodoc 檔案中的條目。

類別
  • Record 保存 Prodoc 資料。

  • Reference 保存 Prodoc 參考文獻的資料。

Bio.ExPASy.Prodoc.read(handle)

從包含單一 Prodoc 記錄的檔案中讀取記錄。

Bio.ExPASy.Prodoc.parse(handle)

迭代 Prodoc 檔案中的記錄。

class Bio.ExPASy.Prodoc.Record

基礎類別:object

保存來自 Prodoc 記錄的資訊。

屬性
  • accession 記錄的登錄號。

  • prosite_refs (prosite 登錄號, prosite 名稱) 的元組列表。

  • text 自由格式文字。

  • references 參考文獻物件列表。

__init__()

初始化類別。

class Bio.ExPASy.Prodoc.Reference

基礎類別:object

保存來自 Prodoc 引用的資訊。

屬性
  • number 參考文獻的編號。(字串)

  • authors 作者姓名。

  • citation 描述引用文獻。

__init__()

初始化類別。