Bio.ExPASy.Enzyme 模組

解析來自 ExPASy 的 Enzyme 的 enzyme.dat 檔案。

請參閱 https://www.expasy.org/enzyme/

已使用 2009 年 3 月 3 日的版本進行測試。

函式

• read 讀取包含一個 ENZYME 條目的檔案

• parse 讀取包含多個 ENZYME 條目的檔案

類別

• Record 保存 ENZYME 資料。

Bio.ExPASy.Enzyme.parse(handle)

解析 ENZYME 記錄。

此函式用於解析包含多個記錄的 ENZYME 檔案。

引數

• handle - 檔案的處理常式。

Bio.ExPASy.Enzyme.read(handle)

讀取一個 ENZYME 記錄。

此函式用於解析僅包含一個記錄的 ENZYME 檔案。

引數

• handle - 檔案的處理常式。

class Bio.ExPASy.Enzyme.Record

基底類別： dict

將 ExPASy ENZYME 記錄中的資訊保存為 Python 字典。

每個記錄包含以下鍵

• ID：EC 編號

• DE：建議名稱

• AN：替代名稱（若有）

• CA：催化活性

• CF：輔因子（若有）

• PR：指向對應於酶的任何 Prosite 文件條目的指標

• DR：指向對應於酶的任何 Swiss-Prot 蛋白質序列條目的指標

• CC：註解

__init__()

初始化類別。

__repr__()

傳回 Record 物件的標準字串表示。

__str__()

傳回 Record 物件的可讀字串表示。