Bio.Emboss.Primer3 模組

用於解析來自 EMBOSS eprimer3 程式輸出的程式碼。

如同 Biopython 中的其他部分，有兩個輸入函式，read 和 parse，分別用於單筆記錄輸出和多筆記錄輸出。對於 primer3，會為每個目標序列建立一個單筆記錄物件，並且可能包含多個引子。

亦即，如果您使用單個目標序列執行 eprimer3，請使用 read 函式。如果您使用多個目標執行 eprimer3，請使用 parse 函式來迭代結果。

class Bio.Emboss.Primer3.Record

基底：object

表示來自 primer3 尋找引子的執行資訊。

成員

• primers - 描述此目標序列之引子對的 Primer 物件列表。

• comments - 記錄的註解行。

__init__()

初始化類別。

class Bio.Emboss.Primer3.Primers

基底：object

由 Primer3 設計的引子組。

成員

• size - 產物長度，注意您可以使用 len(primer) 作為 primer.size 的替代方案

• forward_seq

• forward_start

• forward_length

• forward_tm

• forward_gc

• reverse_seq

• reverse_start

• reverse_length

• reverse_tm

• reverse_gc

• internal_seq

• internal_start

• internal_length

• internal_tm

• internal_gc

__init__()

初始化類別。

__len__()

引子產物的長度（即產物大小）。

Bio.Emboss.Primer3.parse(handle)

將 primer3 輸出作為 Bio.Emboss.Primer3.Record 物件進行迭代。

Bio.Emboss.Primer3.read(handle)

將 primer3 輸出解析為 Bio.Emboss.Primer3.Record 物件。

這適用於當只有一個目標序列時。如果為多個序列設計引子，請使用 parse 函式。