Bio.Emboss.PrimerSearch 模組
與 EMBOSS 的 primersearch 程式互動的程式碼。
- class Bio.Emboss.PrimerSearch.InputRecord
基底:
object
代表 primersearch 程式的輸入檔案。
這使得添加引子資訊並將其寫入簡單的引子檔案格式變得容易。
- __init__()
初始化類別。
- __str__()
將 primersearch 輸入記錄總結為字串。
- add_primer_set(primer_name, first_primer_seq, second_primer_seq)
將引子資訊添加到記錄中。
- class Bio.Emboss.PrimerSearch.OutputRecord
基底:
object
代表 primersearch 工作的資訊。
amplifiers 是一個字典,其中的鍵是引子名稱,值是 PrimerSearchAmplifier 物件的列表。
- __init__()
初始化類別。
- Bio.Emboss.PrimerSearch.read(handle)
將 primersearch 的輸出讀取到 PrimerSearchOutputRecord 中。