Bio.AlignIO.MsfIO 模組

Bio.AlignIO 支援 GCG MSF 格式。

此檔案格式由 GCG PileUp 和 LocalPileUp 工具產生，後來的工具如 T-COFFEE 和 MUSCLE 也支援將其作為可選的輸出格式。

最初的 GCG 工具會在每個序列的末端寫入間隙，這些間隙可能是以波浪號 (~) 表示的遺失資料，而內部間隙則是以句點 (.) 表示。此解析器將兩者都替換為減號 (-)，以與 Bio.AlignIO 的其他部分保持一致。

您應該透過 Bio.AlignIO 函式（如果您想直接使用帶間隙的序列，則使用 Bio.SeqIO 函式）來使用此模組。

class Bio.AlignIO.MsfIO.MsfIterator(handle, seq_count=None)

基底類別：AlignmentIterator

GCG MSF 比對迭代器。

__next__()

從 handle 中解析下一個比對。