Bio.SeqUtils.CheckSum 模組

計算各種序列校驗和的函式。

Bio.SeqUtils.CheckSum.crc32(seq)

返回序列（字串或 Seq 物件）的 crc32 校驗和。

請注意，大小寫很重要

>>> crc32("ACGTACGTACGT")
20049947
>>> crc32("acgtACGTacgt")
1688586483

Bio.SeqUtils.CheckSum.crc64(s)

返回序列（字串或 Seq 物件）的 crc64 校驗和。

請注意，大小寫很重要

>>> crc64("ACGTACGTACGT")
'CRC-C4FBB762C4A87EBD'
>>> crc64("acgtACGTacgt")
'CRC-DA4509DC64A87EBD'

Bio.SeqUtils.CheckSum.gcg(seq)

返回序列（字串或 Seq 物件）的 GCG 校驗和（整數）。

給定核苷酸或胺基酸序列（或任何字串），返回 GCG 校驗和（整數）。GCG 程式使用的校驗和。seq 類型 = str。

基於 BioPerl GCG_checksum。由 Sebastian Bassi 在 John Lenton、Pablo Ziliani 和 Gabriel Genellina 的幫助下改編。

所有序列都會轉換為大寫。

>>> gcg("ACGTACGTACGT")
5688
>>> gcg("acgtACGTacgt")
5688

Bio.SeqUtils.CheckSum.seguid(seq)

返回序列（字串或 Seq 物件）的 SEGUID（字串）。

給定核苷酸或胺基酸序列（或任何字串），返回 SEGUID 字串（A SEquence Globally Unique IDentifier）。seq 類型 = str。

請注意，大小寫並不重要

>>> seguid("ACGTACGTACGT")
'If6HIvcnRSQDVNiAoefAzySc6i4'
>>> seguid("acgtACGTacgt")
'If6HIvcnRSQDVNiAoefAzySc6i4'