Bio.SeqIO.GfaIO 模組

Bio.SeqIO 支援圖形片段組裝格式 (Graphical Fragment Assembly format)。

此格式由許多組裝器輸出,包含不同序列如何組裝在一起的連結資訊,然而,我們只關心片段(序列)資訊。

文件:- 版本 1.x:https://gfa-spec.github.io/GFA-spec/GFA1.html - 版本 2.0:https://gfa-spec.github.io/GFA-spec/GFA2.html

Bio.SeqIO.GfaIO.Gfa1Iterator(source)

GFA 1.x 檔案的解析器。

文件:https://gfa-spec.github.io/GFA-spec/GFA1.html

Bio.SeqIO.GfaIO.Gfa2Iterator(source)

GFA 2.0 檔案的解析器。

版本 2 的文件:https://gfa-spec.github.io/GFA-spec/GFA2.html