Bio.SCOP.Residues 模組

來自 PDB 結構的殘基集合。

class Bio.SCOP.Residues.Residues(str=None)

基礎類別:object

來自 PDB 結構的殘基集合。

此類別提供程式碼來處理 SCOP 結構域定義。 這些定義簡潔地表示為一個或多個鏈片段。 例如,「(1bba A:10-20,B:)」表示 PDB 結構 1bba 中鏈 A 的殘基 10 到 20(包含)以及鏈 B 的每個殘基。PDB ID 和括號是可選的。 此外,「-」表示具有一個未命名鏈的 PDB 結構的每個殘基。

起始和結束殘基 ID 由殘基序列號和一個可選的單字母插入碼組成。例如,「12」、「-1」、「1a」、「1000」

pdbid – 可選的 PDB ID,例如「1bba」

片段 – 一個元組序列 (鏈 ID, 起始殘基 ID, 結束殘基 ID)

__init__(str=None)

初始化類別。

__str__()

將 SCOP 殘基記錄表示為字串。