Bio.AlignIO.EmbossIO 模組
Bio.AlignIO 支援來自 EMBOSS 工具的「emboss」比對輸出。
您應該透過 Bio.AlignIO 函式(如果您想直接使用帶有間隔的序列,則透過 Bio.SeqIO 函式)來使用此模組。
此模組包含用於 EMBOSS 成對/簡單檔案格式的解析器,例如來自 alignret、water 和 needle 工具的輸出。
- class Bio.AlignIO.EmbossIO.EmbossIterator(handle, seq_count=None)
基礎類別:
AlignmentIterator
Emboss 比對迭代器。
用於從 EMBOSS 工具讀取它們稱之為「成對」和「簡單」格式的(成對)比對。
- __next__()
從 handle 解析下一個比對。