Bio.Align.clustal 模組

Bio.Align 支援來自 CLUSTAL W 和其他工具的「clustal」輸出。

您應該透過 Bio.Align 函數(或如果您只對序列感興趣,則透過 Bio.SeqIO 函數)使用此模組。

class Bio.Align.clustal.AlignmentWriter(target)

基底類別:AlignmentWriter

Clustalw 比對寫入器。

fmt: str | None = 'Clustal'
write_header(stream, alignments)

使用此函式寫入檔案標頭。

format_alignment(alignment)

傳回一個字串,其中包含 Clustal 格式的單個比對結果。

__abstractmethods__ = frozenset({})
class Bio.Align.clustal.AlignmentIterator(source)

基底類別:AlignmentIterator

Clustalw 比對迭代器。

fmt: str | None = 'Clustal'
__abstractmethods__ = frozenset({})