Bio.SwissProt.KeyWList 模組
用於解析 SwissProt/UniProt 的 keywlist.txt 檔案的程式碼。
- 參見
- 類別
Record 儲存 keywlist.txt 檔案中關於一個關鍵字或一個類別的資訊。
- 函數
parse 解析 keywlist.txt 檔案,並傳回一個包含記錄的迭代器。
- class Bio.SwissProt.KeyWList.Record
基底:
dict
儲存關鍵字列表中的一個關鍵字或類別的資訊。
這個記錄將 keywlist.txt 中一個關鍵字或類別的資訊儲存為 Python 字典。此字典中的鍵是 keywlist.txt 檔案中可能出現的行代碼。
--------- --------------------------- ---------------------- Line code Content Occurrence in an entry --------- --------------------------- ---------------------- ID Identifier (keyword) Once; starts a keyword entry IC Identifier (category) Once; starts a category entry AC Accession (KW-xxxx) Once DE Definition Once or more SY Synonyms Optional; once or more GO Gene ontology (GO) mapping Optional; once or more HI Hierarchy Optional; once or more WW Relevant WWW site Optional; once or more CA Category Once per keyword entry; absent in category entries
- __init__()
初始化類別。
- Bio.SwissProt.KeyWList.parse(handle)
從檔案處理解析關鍵字列表。
傳回一個產生器物件,該物件會產生關鍵字條目作為 Bio.SwissProt.KeyWList.Record() 物件。