Bio.SeqUtils.lcc 模組

局部組成複雜度 (Local Composition Complexity)。

Bio.SeqUtils.lcc.lcc_mult(seq, wsize)

計算滑動窗口的局部組成複雜度 (LCC) 值。

返回一個浮點數列表，表示序列上滑動窗口的 LCC 值。

seq - 一個明確的 DNA 序列 (字串或 Seq 物件) wsize - 窗口大小，整數

結果與多次應用 lcc_simp 相同，但此版本已針對速度進行最佳化。最佳化方式是使用前一個窗口的值作為基礎來計算下一個窗口的值。

Bio.SeqUtils.lcc.lcc_simp(seq)

計算序列的局部組成複雜度 (LCC)。

seq - 一個明確的 DNA 序列 (字串或 Seq 物件)

返回整個序列的局部組成複雜度 (LCC) 值 (浮點數)。

參考文獻：Andrzej K Konopka (2005) Sequence Complexity and Composition https://doi.org/10.1038/npg.els.0005260