Bio.SeqIO.SwissIO 模組

Bio.SeqIO 支援 "swiss" (又稱 SwissProt/UniProt) 檔案格式。

您應透過 Bio.SeqIO 函數使用此模組。另請參閱 Bio.SwissProt 模組，其提供的功能不僅僅是將序列作為 SeqRecord 物件存取。

另請參閱 Bio.SeqIO.UniprotIO.py，其支援 "uniprot-xml" 格式。

Bio.SeqIO.SwissIO.SwissIterator(source)

將 Swiss-Prot/UniProt 檔案分解為 SeqRecord 物件。

參數 source 為類檔案物件或檔案路徑。

從 ID 行到終止 // 的每個區段都會成為單一 SeqRecord，並具有相關的註釋和特徵。

此解析器適用於平坦檔案的 "swiss" 格式，如以下所用：

• Swiss-Prot 又稱 SwissProt

• TrEMBL

• UniProtKB 又稱 UniProt Knowledgebase

為了與 BioPerl 和 EMBOSS 保持一致，我們稱此格式為 "swiss"。另請參閱 SeqIO 對 "uniprot-xml" 格式的支援。

您應透過 Bio.SeqIO.parse(…, format="swiss") 使用此解析器，而不是直接呼叫它。