Bio.Align.fasta 模組

Bio.Align 支援對齊的 FASTA 檔案。

對齊的 FASTA 檔案是 FASTA 檔案,其中序列中的對齊間隙用破折號表示。對齊的 FASTA 中的每個序列行應具有相同的長度。

class Bio.Align.fasta.AlignmentWriter(target)

基礎類別:AlignmentWriter

用於對齊 FASTA 檔案格式的對齊檔案寫入器。

fmt: str | None = 'FASTA'
format_alignment(alignment)

傳回具有對齊 FASTA 格式的對齊字串。

__abstractmethods__ = frozenset({})
class Bio.Align.fasta.AlignmentIterator(source)

基礎類別:AlignmentIterator

用於對齊 FASTA 檔案的對齊迭代器。

對齊的 FASTA 檔案包含一個多重對齊。序列行中的對齊間隙用破折號表示。標頭行以「>」開頭,後接序列的名稱,以及可選的描述。

fmt: str | None = 'FASTA'
__abstractmethods__ = frozenset({})