Bio.Align.fasta 模組
Bio.Align 支援對齊的 FASTA 檔案。
對齊的 FASTA 檔案是 FASTA 檔案,其中序列中的對齊間隙用破折號表示。對齊的 FASTA 中的每個序列行應具有相同的長度。
- class Bio.Align.fasta.AlignmentWriter(target)
基礎類別:
AlignmentWriter
用於對齊 FASTA 檔案格式的對齊檔案寫入器。
- fmt: str | None = 'FASTA'
- format_alignment(alignment)
傳回具有對齊 FASTA 格式的對齊字串。
- __abstractmethods__ = frozenset({})
- class Bio.Align.fasta.AlignmentIterator(source)
基礎類別:
AlignmentIterator
用於對齊 FASTA 檔案的對齊迭代器。
對齊的 FASTA 檔案包含一個多重對齊。序列行中的對齊間隙用破折號表示。標頭行以「>」開頭,後接序列的名稱,以及可選的描述。
- fmt: str | None = 'FASTA'
- __abstractmethods__ = frozenset({})