食譜條目

「食譜」類別中的條目旨在補充教程 (PDF) 中提供的通用幫助，並提供可以使用 Biopython 工具解決的特定問題示例。

此範例集合是 Biopython 的一項新嘗試，因此目前內容還比較少。如果您對主題有任何建議，請在郵件列表上提出。如果您有一些自己的示例程式碼要放入此食譜集合中，那就更好了。透過分享，希望社群可以評論您的程式碼，並可能加以改進，從而幫助您和未來的 Biopython 使用者。

或者，您認為教程 (PDF) 中有哪些範例值得複製（或移動）到這裡？請在郵件列表上告知我們。

謝謝

• 繪製 ABI 追蹤圖
• 表示來自 ACE 檔案中存檔的 contig 的序列比對。
• 使用 Entrez 模組檢索和註釋 Entrez 基因 ID。
• 使用 Bio.Nexus 模組串聯多個序列比對 NEXUS 檔案。
• 使用 Bio.SeqIO 模組轉換序列檔案。
• 使用 Bio.SeqUtils.Mapper 模組對應基因座標。
• 簡併密碼子的方法
• 使用 GFF 模組從基因序列到預測蛋白質。
• 從序列中提取基因間區域的工作流程。
• Bio.Phylo 食譜。
• 從 UNIX 管道讀取資料。
• 使用 Biopython 讀取大型 PDB 檔案。
• 使用 Bio.PDB 模組移除 PDB 無序原子。
• 檢索不匹配的 blast 查詢
• 序列清理器
• 分割大型檔案