原始碼

簡介

Biopython 目前以寬鬆的「Biopython 許可協議」發布，但作為切換到更常用的「3-Clause BSD 許可協議」的計畫一部分，部分程式碼明確地以這兩種選項的其中一種雙重授權。詳情請參閱我們的許可證檔案。

Biopython 原始碼 保存在一個分散式版本控制系統下，允許來自世界各地的多個使用者同時在同一個程式碼庫上工作。我們目前使用 git (由 Linus Torvalds 為 Linux 核心開發) 並託管在 GitHub 上。

我們的核心開發人員維護一個穩定的主幹，當新功能整合且錯誤修復後，我們會從中推出版本。

檢視原始碼

您可以在 github 上瀏覽我們最新的原始碼。

追蹤變更

您可以透過 RSS 訂閱 或 Biopython 郵件列表 來追蹤程式碼開發。另請參閱我們的其他郵件列表。

下載最新原始碼

您可以透過點擊 Biopython GitHub 頁面頂端附近的「下載」連結來下載最新的原始碼（這將提供您一個 tar ball 或 zip 檔案）。

匿名存取

使用 git 命令列工具獲取儲存庫的副本（在 git 術語中稱為「克隆」）非常簡單，您不需要帳號或密碼

git clone https://github.com/biopython/biopython.git

此命令會在您的機器上建立整個 Biopython 儲存庫的本機副本（您自己的官方儲存庫個人副本，包含其完整的歷史記錄）。您可以使用以下命令在命令列（從 Biopython 儲存庫目錄內）更新此本機副本：

git pull origin

您甚至可以對此本機副本進行本機變更並提交，詳情請參閱 GitUsage 或 git 文件。

寫入權限

大多數變更會透過 GitHub 以 pull request 的方式提交。

為了直接對官方儲存庫進行變更，您需要一個具有協作者狀態的 GitHub 帳號。Biopython 開發人員（包括所有先前擁有 CVS 提交權限的人員）可以使用寫入權限。

這通常是根據個案給予，而討論如何取得寫入權限的最佳場所是在 Biopython 郵件列表。

取得權限後，請參閱 GitUsage 上的說明

從 CVS 遷移

大多數其他 Open Bioinformatics Foundation 專案都從 CVS 遷移到 SVN (Subversion)，然後遷移到託管在 GitHub 上的 git。

雖然 Biopython 確實考慮過從 CVS 遷移到 SVN，但我們在 2009 年 9 月直接從 CVS 遷移到 git。