• Wiki 文件

Biopython 中的族群遺傳學

Biopython 在 Bio.PopGen 模組中提供了族群遺傳學功能。

1. 存取 Genepop 方法（用於 Hardy-Weinberg 平衡、族群分化、基因型不平衡的精確檢定、F 統計量、無效等位基因頻率、微衛星的基於等位基因大小的統計量等等）。
2. 通過 SIMCOAL2 和 fastsimcoal2 進行溯祖模擬。
3. 通過 fdist2 進行選擇檢測。

有關如何使用 Bio.PopGen 存取 Genepop 的文件，請參見此處。

與 SIMCOAL2 和 fdist2 互動的文件，可以在教學中的 PopGen 章節找到 (PDF)。

其他軟體

Python 程式設計師可能需要考慮 PyPop，其中包含族群內頻率統計和 simuPOP，用於前向時間族群遺傳學。

未來發展

關於未來可能發展的任何註記（或討論）應限制在 PopGen 開發頁面。